培養(yǎng)箱安裝完畢以及灌好水后，可按下列步驟操作。
1.   打開(kāi)箱門，工作室內(nèi)處理干凈，放好擱板。
2.   需濕度時(shí)將濕度盤中加入2/3水，放置在工作室底部，關(guān)上箱門。
3.   打開(kāi)控制箱背后的電源開(kāi)關(guān)，此時(shí)培養(yǎng)箱應(yīng)有溫度顯示，及高水位指示燈亮。
4.   按一下“殺菌”鍵，對(duì)工作室進(jìn)行滅菌消毒。（注意：箱內(nèi)有培養(yǎng)物時(shí)，請(qǐng)勿按此鍵！！）滅菌結(jié)束后再按一下“殺菌”鍵,關(guān)閉殺菌燈。
5.   shou先設(shè)定好所需的溫度，對(duì)培養(yǎng)箱進(jìn)行加溫。（詳見(jiàn)五、控制器操作說(shuō)明）
6.    待溫度恒定后，可打開(kāi)箱門放入培養(yǎng)物。
7.   按面板上“氣泵1”或“氣泵2”鍵，啟動(dòng)氣泵1（或2），慢慢調(diào)節(jié)空氣流量計(jì)針型閥（逆時(shí)針開(kāi))一般按5%CO2濃度配比，空氣流量可調(diào)**760ml∕min。
8.   打開(kāi)CO2氣體鋼瓶總閥門、調(diào)節(jié)CO2減壓閥，使輸出壓力為0.06Mpa（約0.6kgf∕cm2）左右，開(kāi)啟穩(wěn)壓閥(順時(shí)針開(kāi))一般出廠時(shí)已打開(kāi)，再慢慢調(diào)CO2流量計(jì)**40ml∕min（逆時(shí)針開(kāi)）。(CO2濃度﹦40/(760﹢40)﹦5%V∕V）。                                                  
9.   完成上述調(diào)節(jié)后，待內(nèi)室溫度穩(wěn)定后，該設(shè)備即可進(jìn)入自動(dòng)控制培養(yǎng)狀態(tài)。
10. 如要觀察洗滌瓶及PH溶液時(shí)，可按面板上“照明”鍵，打開(kāi)照明燈。
11. 當(dāng)培養(yǎng)箱停止工作時(shí)請(qǐng)按以下步驟進(jìn)行：
1)   關(guān)閉CO2鋼瓶開(kāi)關(guān)，及減壓閥。
2)   關(guān)閉氣泵電源，氣泵停止工作。
3)   打開(kāi)箱門，取出濕度盤。并用手頂住門開(kāi)關(guān)使培養(yǎng)箱在開(kāi)門情況下工作幾分鐘，以散去箱內(nèi)水汽。
4)   關(guān)門繼續(xù)加溫工作十分鐘左右，關(guān)閉電源，清潔內(nèi)部。